某日，一群使用风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人所言，这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团，如今他们怀着复仇之心再次出现。卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责侦查空之团的老巢，...

　　幽灵军团的黄泉（中村秀利 配音）通过神秘的暗黑医疗术，复活了具有足以毁灭世界恐怖力量的魔物魍魉（加藤精三 配音），希望以此建立黑暗的千年王国。魍魉俯身于黄泉身上，随即命令幽灵军团攻打鬼之国，企图杀害具有封印魔物和预言...

木叶村遭到神秘忍者集团的偷袭，伤亡惨重。一场可怕的忍界大战即将爆发。鸣人一行为了解救危机踏上旅途，失踪已久的佐助竟出乎意料地出现在大家面前。佐助为了向兄长鼬复仇而离开故乡，此番回来究竟是敌是友？而神秘忍者集团的真正目的又...

鸣人这次的任务是保护鬼之国的巫女紫苑。紫苑拥有两个独一无二的能力。一个是将复活的魔物重新封印；另一个是预言人的死期。紫苑的预言从来没有落空过。然而她对鸣人作出了死之预言——“鸣人，你会死。”只有一个办法可以逃避紫苑所预言...